根据医师治疗经验，严重急性呼吸道症候群（SARS）患者有部分会有轻微的腹泻，多半是软便或者较不成形的粪便，每日一到三次；跟一般的吃坏肚子不太一样。台湾所见的病例，多数在发烧时会伴随有轻微腹泻。有些研究报告指出，在粪便中可找到SARS病毒。

至于如感染SARS是否会肚子痛，医疗界认为，肚子痛和腹泻不是同一个症状，而在报告的病例和统计数据当中，肚子痛的症状并没有被特别提出来，表示大多数的病例应该没有这个症状。

也有人担心SARS在潜伏期是否有传染力，医界目前的研究和资料，没有明显证据可以证明SARS在潜伏期会有传染力，同样的也无法证明潜伏期没有传染力。目前国际医学专家都致力于研究这个问题中。

对SARS疑似患者的最初诊断和测试应该包括胸透、血氧浓度、血培养、痰革兰液染色及培养, 同时检测病毒性呼吸病原体, 特别是A型和B型流感病毒和呼吸性合胞体病毒。此外，也应该考虑对样本做退伍军人症肺炎抗原和肺炎球菌的尿液抗原检测。临床医生应该为其它检测保留任何可能的临床样本 (呼吸道分泌物,血液, 血清) 直到最后作出诊断。应该收集SARS确诊患者急性期和恢复期（发现临床症状21天后）的血清样本。成对的血清样本及其它样本可以通过州及地方卫生部门送达联邦疾病控制中心检测。收集疑似SARS患者临床样本的具体规定已制定。
　　在诊断疑似病例过程中，临床医生应该将常规预防措施 (例如手的清洁) 与空气传播预防措施（例如佩戴N-95防护口罩）以及接触传播预防措施（例如穿着防护服和配戴手套）结合起来使用。在该病的传播方式得以明确之前，在与病人接触时，还应配戴眼部防护罩。